学校于2009年开始招收、培养全日制硕士专业学位研究生。2010年，学校成为首批开展专业学位研究生教育综合改革试点的64所高校之一。2015年，学校获教育部批准开展深化专业学位研究生教育综合改革试点(全国仅12所高校入选)。2018年，学校获批工程博士专业学位授权点(全国仅41所高校入选)。截止目前，学校拥有资源与环境、能源动力2个工程类博士专业学位授权点;拥有电子信息、机械、材料与化工、资源与环境、能源动力、土木水利、生物与医药等7个工程类硕士专业学位和工商管理、会计、金融、翻译、汉语国际教育、工程管理、应用统计、法律等8个非工程类硕士专业学位授权点。目前,学校建有214个研究生校外实践基地，分布于北京、上海、广东、天津、河北、新疆等全国24个省、自治区、直辖市;其中，北京工程师学院、克拉玛依工程师学院、中国石油东方地球物理公司等3个基地入选全国示范性工程专业学位研究生联合培养基地。